В сентябре климат в Зай-Каратае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Зай-Каратае 11 дождливых, 7 с переменной облачностью, 6 ясных и 6 пасмурных дней. Дожди преимущественно умеренные.