В сентябре климат в Якты-Куле можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 17 градусов тепла. В среднем в сентябре в Якты-Куле 11 дождливых, 7 ясных, 7 с переменной облачностью и 5 пасмурных дней. Дожди преимущественно умеренные.