В сентябре климат в Сельском поселении Верхней Балкарии можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Сельском поселении Верхней Балкарии 23 дождливых и 7 ясных дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в апреле, мае, июне и июле Сельское поселение Верхняя Балкария cчитается местом, некомфортным для посещения.