В июне климат в Северомуйске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 14 градусов тепла. В среднем в июне в Северомуйске 12 дождливых, 7 пасмурных, 6 с переменной облачностью и 5 ясных дней. Дожди преимущественно умеренные.