В июне климат в Северо-Агеевском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 21 градус тепла. В среднем в июне в Северо-Агеевском 13 дождливых, 11 ясных и 6 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.