В мае климат в Сан-Педро-де-Атакама можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в мае 15 градусов тепла. В среднем в мае в Сан-Педро-де-Атакама 28 ясных, 2 с переменной облачностью и дождливый день. Дожди преимущественно слабые.