В сентябре климат в Пугачеве можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 19 градусов тепла. В среднем в сентябре в Пугачеве 12 дней с переменной облачностью, 9 ясных, 7 дождливых и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно слабые.