В мае климат в Пуэрто-Наталес можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в мае 4 градуса тепла. В среднем в мае в Пуэрто-Наталес 11 дождливых, 11 с переменной облачностью, 8 пасмурных и 1 ясный день. Дожди преимущественно сильные. В мае, а также в январе, феврале, марте и апреле Пуэрто-Наталес cчитается местом, некомфортным для посещения.