Июнь в Пуэрто-ла-Крус — самый дождливый месяц в году. В июне климат в Пуэрто-ла-Крус можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Пуэрто-ла-Крус 26 дождливых и 4 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, июле, августе и сентябре Пуэрто-ла-Крус cчитается местом, некомфортным для посещения.