В сентябре климат в Пуэрто-Бакерисо-Морено можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 21 градус тепла. В среднем в сентябре в Пуэрто-Бакерисо-Морено 26 пасмурных, 2 ясных и 2 дня с переменной облачностью. В сентябре, а также в январе, марте, июне и июле Пуэрто-Бакерисо-Морено cчитается местом, комфортным для посещения.