В сентябре климат в Оротукане можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 8 градусов тепла. В среднем в сентябре в Оротукане 10 дней с переменной облачностью, 8 дождливых, 7 пасмурных, 4 ясных и 1 день со снегом. Дожди преимущественно сильные.