В сентябре климат в Новотроицком можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Новотроицком 14 пасмурных, 6 ясных, 5 дождливых и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые.