В сентябре климат в Новотроицке можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Новотроицке 10 дней с переменной облачностью, 8 ясных, 7 дождливых и 5 пасмурных дней. Дожди преимущественно слабые.