В сентябре климат в Момбасе можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Момбасе 18 дождливых, 6 ясных и 6 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в марте, апреле, мае и июне Момбаса cчитается местом, некомфортным для посещения.