В сентябре климат в Межегее можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Межегее 12 дней с переменной облачностью, 11 ясных и 7 дождливых дней. Дожди преимущественно слабые.