В сентябре климат в Марьиных Колодцах можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 22 градуса тепла. В среднем в сентябре в Марьиных Колодцах 18 ясных, 7 с переменной облачностью и 5 дождливых дней. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в августе Марьины Колодцы cчитается местом, комфортным для посещения.