В июне климат в Манадо можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Манадо 26 дождливых, 2 с переменной облачностью, 1 ясный и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, марте и апреле Манадо cчитается местом, некомфортным для посещения.