Сентябрь в Мальдонадо — самый дождливый и ветреный месяц в году. В сентябре климат в Мальдонадо можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 16 градусов тепла. В среднем в сентябре в Мальдонадо 11 дней с переменной облачностью, 10 ясных, 7 дождливых и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в июне и июле Мальдонадо cчитается местом, некомфортным для посещения.