В июне климат в Кызыл-Хае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 12 градусов тепла. В среднем в июне в Кызыл-Хае 17 дождливых, 6 ясных, 6 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, июле и августе Кызыл-Хая cчитается местом, некомфортным для посещения.