В июне климат в Кысыле-Сыре можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 21 градус тепла. В среднем в июне в Кысыле-Сыре 14 дней с переменной облачностью, 9 ясных, 4 дождливых и 3 пасмурных дня. Дожди преимущественно умеренные. В июне, а также в июле Кысыл-Сыр cчитается местом, комфортным для посещения.