В сентябре климат в Караколе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 11 градусов тепла. В среднем в сентябре в Караколе 11 дождливых, 11 ясных и 8 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Каракол cчитается местом, некомфортным для посещения.