В июне климат в Джэксонвилле можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 31 градус тепла. В среднем в июне в Джэксонвилле 19 дождливых, 9 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в июле, августе и сентябре Джэксонвилл cчитается местом, некомфортным для посещения.