В июне климат в Джексонвилл Бич можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 29 градусов тепла. В среднем в июне в Джексонвилл Бич 18 дождливых, 7 ясных и 5 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в июле, августе и сентябре Джексонвилл Бич cчитается местом, некомфортным для посещения.