В июне климат в Халикунасе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 25 градусов тепла. В среднем в июне в Халикунасе 29 ясных и 1 день с переменной облачностью. В июне, а также в мае Халикунас cчитается местом, комфортным для посещения.