В сентябре климат на Кокосовых островах можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 27 градусов тепла. В среднем в сентябре на Кокосовых островах 28 дождливых, 1 ясный и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Кокосовые острова cчитается местом, некомфортным для посещения.