В сентябре климат в Чистюньке можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чистюньке 14 дней с переменной облачностью, 11 ясных, 4 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно слабые.