В сентябре климат в Чарышском можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чарышском 15 ясных, 9 дождливых и 6 дней с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные.