В сентябре климат в Чагояне можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 14 градусов тепла. В среднем в сентябре в Чагояне 13 дней с переменной облачностью, 10 ясных, 6 дождливых и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно слабые.