В сентябре климат в Богучанах можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 12 градусов тепла. В среднем в сентябре в Богучанах 11 дождливых, 8 пасмурных, 6 с переменной облачностью и 5 ясных дней. Дожди преимущественно слабые.