В сентябре климат в Бежецке можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Бежецке 14 дождливых, 10 пасмурных, 4 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в апреле, октябре и ноябре Бежецк cчитается местом, некомфортным для посещения.