В сентябре климат в Байкальске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 12 градусов тепла. В среднем в сентябре в Байкальске 14 ясных, 10 с переменной облачностью и 6 дождливых дней. Дожди преимущественно слабые.