В сентябре климат в Амдерме можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в сентябре 6 градусов тепла. В среднем в сентябре в Амдерме 12 дождливых, 9 с переменной облачностью, 6 пасмурных и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и июне Амдерма cчитается местом, некомфортным для посещения.