В июне климат в Алагоиньясе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 26 градусов тепла. В среднем в июне в Алагоиньясе 18 дождливых, 10 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В июне, а также в феврале, марте, апреле и мае Алагоиньяс cчитается местом, некомфортным для посещения.