В сентябре климат в Агиа-Марине можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 24 градуса тепла. В среднем в сентябре в Агиа-Марине 27 ясных и 3 дождливых дня. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в июне, июле и августе Агиа-Марина cчитается местом, комфортным для посещения.