Сентябрь в Агараке — самый дождливый месяц в году. В сентябре климат в Агараке можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 12 градусов тепла. В среднем в сентябре в Агараке 14 дождливых, 13 пасмурных и 3 ясных дня. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и октябре Агарак cчитается местом, некомфортным для посещения.