В июне климат в Заполярном можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 12 градусов тепла. В среднем в июне в Заполярном 14 дождливых, 9 пасмурных, 4 с переменной облачностью и 3 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В июне, а также в январе, феврале, апреле и мае Заполярный cчитается местом, некомфортным для посещения.