В сентябре климат в Ягоднинском сельсовете можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 15 градусов тепла. В среднем в сентябре в Ягоднинском сельсовете 10 дождливых, 8 с переменной облачностью, 6 ясных и 6 пасмурных дней. Дожди преимущественно слабые.