В сентябре климат в Вологде можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 12 градусов тепла. В среднем в сентябре в Вологде 15 дождливых, 12 пасмурных, 2 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в январе, апреле и октябре Вологда cчитается местом, некомфортным для посещения.