В мае климат в Северо-Енисейском можно охарактеризовать как холодный. Средняя температура днём в мае 7 градусов тепла. В среднем в мае в Северо-Енисейском 18 дождливых, 11 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно умеренные. В мае, а также в январе, феврале, апреле и сентябре Северо-Енисейский cчитается местом, некомфортным для посещения.