В сентябре климат в Саяногорске можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 13 градусов тепла. В среднем в сентябре в Саяногорске 11 ясных, 9 дождливых, 9 с переменной облачностью и 1 пасмурный день. Дожди преимущественно умеренные.