В сентябре климат в Сан-Карлос-де-ла-Рапита можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 24 градуса тепла. В среднем в сентябре в Сан-Карлос-де-ла-Рапита 23 ясных, 6 с переменной облачностью и дождливый день. Дожди преимущественно слабые. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Сан-Карлос-де-ла-Рапита cчитается местом, комфортным для посещения.