В сентябре климат в Сан-Педро-дель-Икуамандийю можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Сан-Педро-дель-Икуамандийю 16 ясных, 11 с переменной облачностью и 3 дождливых дня. Дожди преимущественно сильные.