В июне климат в Сан-Кристобаль-де-лас-Касасе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 25 градусов тепла. В среднем в июне в Сан-Кристобаль-де-лас-Касасе 26 дождливых, 2 ясных и 2 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в мае, июле, августе и сентябре Сан-Кристобаль-де-лас-Касас cчитается местом, некомфортным для посещения.