В июне климат в Мерса-Матрухе можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 26 градусов тепла. В среднем в июне в Мерса-Матрухе 30 ясных дней. В июне, а также в апреле, мае, октябре и ноябре Мерса-Матрух cчитается местом, комфортным для посещения.