В сентябре климат в Манаду можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в сентябре 28 градусов тепла. В среднем в сентябре в Манаду 24 дождливых, 3 ясных и 3 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в мае, июне, июле и августе Манаду cчитается местом, некомфортным для посещения.