В сентябре климат в Малайбалае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в сентябре 23 градуса тепла. В среднем в сентябре в Малайбалае 30 дождливых дней. Дожди преимущественно сильные. В сентябре, а также в январе, феврале, марте и апреле Малайбалай cчитается местом, некомфортным для посещения.