Средняя температура днём в сентябре 10 градусов тепла. В среднем в сентябре в Лесосибирске 14 дождливых, 10 пасмурных, 5 ясных и 1 день с переменной облачностью. Дожди преимущественно умеренные. В сентябре, а также в январе, феврале, апреле и мае Лесосибирск cчитается местом, некомфортным для посещения.