В апреле климат в Лабуан-Баджо можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в апреле 28 градусов тепла. В среднем в апреле в Лабуан-Баджо 23 дождливых, 5 ясных и 2 пасмурных дня. Дожди преимущественно сильные. В апреле, а также в январе, феврале, марте и ноябре Лабуан-Баджо cчитается местом, некомфортным для посещения.