В июне климат в Кызыл-Хае можно охарактеризовать как теплый. Средняя температура днём в июне 12 градусов тепла. В среднем в июне в Кызыл-Хае 21 дождливый, 5 ясных и 4 дня с переменной облачностью. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в январе, феврале, мае и июле Кызыл-Хая cчитается местом, некомфортным для посещения.