В июне климат в Кисангани можно охарактеризовать как жаркий. Средняя температура днём в июне 28 градусов тепла. В среднем в июне в Кисангани 18 дождливых, 7 с переменной облачностью, 3 пасмурных и 2 ясных дня. Дожди преимущественно сильные. В июне, а также в марте, апреле, мае и июле Кисангани cчитается местом, некомфортным для посещения.